“Menjadi Program Studi Doktor Pendidikan Agama Kristen unggulan dalam bidang pendidikan, penelitian dan pengabdian kepada masyarakat; sehingga mampu melahirkan lulusan yang berkualitas dan berkualifikasi dalam konteks kehidupan masyarakat di Indonesia dan gereja yang berdasarkan Pancasila dan nilai-nilai kristiani pada tahun 2034.”

Untuk mencapai visi ini, Program Studi Doktor Pendidikan Agama Kristen, Program Pascasarjana Universitas Kristen Indonesia mengemban misi sebagai berikut:

1. Mengembangkan dan menyelenggarakan pendidikan, penelitian dan pengabdian kepada masyarakat berdasarkan kaidah keilmuan yang berbasis kepada integrasi iman Kristen.
2. Membangun sumber daya manusia yang inovatif, kreatif dan berintegritas untuk mampu menguasai prinsip-prinsip keilmuan dan praktik iman Kristen sesuai dengan kebutuhan masyarakat sesuai dengan perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi.
3. Mengembangkan suasana akademis dengan kaidah ilmiah yang menjunjung tinggi nilai-nilai kristiani yang berkarakter.
4. Mengembangkan kerjasama dengan institusi nasional/internasional, pemerintah dan lembaga kristiani dengan semangat ekumenis yang berkelanjutan.